《合金弹头3》原作是在2000年针对Neo-Geo MVS街机发行的。之后该作品曾被移植到各种平台，包括安卓、iOS、PS2、PSP、Wii、Xbox和Xbox 360。作为合金弹头系列的第4代作品，也是系列中最后一部以SNK名义制作发行的作品，这款作品被很多爱好者认为这是系列中素质最高的一部，其难度在系列中也是最高的。
这一Steam版的《合金弹头3》完全支持Steam的大图片模式、成就以及排行榜。游戏方式仍然继承自之前的合金弹头系列作品，但首次出现了分支路线的设定：除了最后一关，前四关均可以有多种不同路线可供选择，每条路线的场景和敌人均不同，但最后面对的BOSS是一样的。
游戏共有五关，但最后一关路线特别长，因此总体流程长度依然和之前几代相差无几。除去传统的动作射击版面，游戏还增加了水下版面、横版和纵版飞行射击版面，此时的游戏方式更接近飞行射击游戏而不是动作射击。
莫丁将军妄图建立世界新秩序的反叛业已成为历史，和平与秩序开始重归世界。虽然东山再起的莫丁势力开始策划新一场政变，但已洞察迹象的政府军也已准备好了新一次的对反叛者的打击。在镇压莫丁反叛中立下汗马功劳的“游隼”队员马可和塔尔玛在退役申请被驳回后被继续任命带领队伍作战。因为莫丁虽然已被他的追随者们认为失踪，但这些追随者们依然潜藏在世界各个角落，而马可和塔尔玛的能力和经验是对付他们的有效利器，通过对反叛军的战斗，二人发现了莫丁和这个新的征服世界的邪恶计划的千丝万缕的联系。
另一方面，隶属政府情报机关的“麻雀”部队在游隼对莫丁的追击的同时也遭遇一系列奇怪事件：神秘消失的家畜、政府官员的失踪，还有反常的巨大生物。诸多事件表明了一个可怕的事实：莫丁并不是唯一值得提防的对象。最后发现：曾在前一次莫丁叛乱中出现的外星人回来了！在共同的敌人面前，政府军和莫丁反乱军组成了反抗外星人的联盟。
