《囧魂》一如既往地，故事开始在一天清晨。那个普通的早上，一位普通的少年在一间普通的房屋里醒来，发现自己的床边站着一个不普通的大叔，并给了他新的名字……
在早饭的诱惑下，发现自己莫名其妙地掉落到二次元世界的少年接受了不属于自己的名字，也接受了随之而来的一系列RP命运，甚至结交了新的同伴，为了返回现实而硬着头皮向这个充满囧和危险的世界进发。然而在这段旅程的终点，等待着他的是……
游戏中直接露过面的ACG人物共400余名，分别出自一百多部不同的作品。主线为传统的冒险旅程式，支线内容则从婚姻介绍到寻找BUG五花八门，很多商店里买不到的高级装备和特殊物品、乃至主角们的许多技能都是通过支线获得的。游戏结局共六种，其中完美结局需要满足一定的条件才能进入，所有结局都可以在一周目中通过最后的选择达成，所以不必担心无法看全。
游戏的基本战斗方式是较为简单的回合制战斗，在此基础上增加了合体技等按照各场战斗的不同需要所作的修改。遇敌方式包括野外的暗雷遇敌和通过与NPC对话、参加天空竞技场挑战赛等方式触发的明雷，在游戏后期的某地点还有机会重新挑战包括BOSS在内的各种强敌，如果早期被虐了可以带着后期的高等级跑去复仇……
战斗以外的游戏系统也是尽力以简洁实用为第一优先，在此基础上尽可能地加入了各种增加趣味度和便利性的细节。
整个游戏中共有20余张可以随时在相册中回顾的原创CG，Gameover图和片尾动态图也都是用特别绘制的原创图制作的。主角四人组的头像和战斗图均为自绘，此外还有大量原创或自改行走图和部分原创的技能动画、地图图块、物品图标等。NPC头像和战斗图则多数来自原作，有部分是以原作为基础修改或自绘的，几乎所有NPC都有自己的头像。
