《爱丽丝：疯狂回归》是改篇自爱丽丝梦游仙境的故事。11年前，一场恐怖的大火夺走了爱丽丝一家人的性命，爱丽丝本身也严重的烧伤了。除了身体上的伤，爱丽丝的精神也大受打击。之后她被限制了到Rutledge收容所接受治疗，之后就发生了爱丽丝梦游仙境的故事。
在十年之后，她终于康复了，但是她仍然负那悲剧的心理重荷。在《爱丽丝：疯狂回归》中，爱丽丝已经出院了，但是可怕的幻觉继续困扰她和侵略她的现实生活，她必须再进入仙境中，寻找答案并终结这个恶梦。
心情复杂的爱丽丝经过接受治疗的孩子们的宿舍来到楼下。楼下左手边的房间是爱丽丝在这里的住所，墙壁上挂着全家一起的昏黄色照片，自顾自的抱怨一番后爱丽丝走出了住所看到街道上弥漫着懒散的世俗气息。
人声嘈杂的市场中一只白猫吸引了爱丽丝的注意，仿佛它在指引一条寻找记忆的道路，爱丽丝不由自主地跟上了白猫的脚步。白猫穿越街道的同时还不忘回头看着爱丽丝是否跟上，仿佛通了灵性一般。最终白猫消失在雾气缭绕的胡同尽头，爱丽丝胆怯地跟了上去，这时爱丽丝的背后突然出现兔头人身的怪物，并不是一只而是许多的怪物将爱丽丝团团围住。
此时，爱丽丝被人轻拍一下恢复了正常，原来是幻觉。来人正是爱丽丝所在的医院中的老婆婆护士，她同爱丽丝讲述了自己一直没有说出的秘密，爱丽丝残存的记忆片断是真实的。爱丽丝来到婆婆所说的房顶，再次向婆婆询问细节。突然变成怪物的婆婆把爱丽丝吓了一跳，地面裂开爱丽丝掉入了深渊。
恢复意识后的爱丽丝已经换上了身上带有血迹的蓝色长裙，而对面的猫开始至“欢迎词”。景色优美的完美世界真的不再完美了吗?爱丽丝踏上了冒险的旅程。借助色子形状的空中踏板和巨大的蘑菇爱丽丝看到了挂着吊牌的巨大酒瓶还在流着紫色的液体，这里很熟悉好像以前来过，这时会说话的猫再次出现为其讲解这种神奇的液体可以让爱丽丝缩小。
爱丽丝接连穿过几个钥匙孔般的洞穴后借助蓝色蘑菇跳上了一条绿色的甬道，顺着甬道滑下到底后发现这里的河流竟然是血红色的。爱丽丝从中央的巨骨上获得了曾经使用的小刀，虽然嘴里说着回来并不想杀戮，不过心里好像是在窃喜。敌人首次登场，挥舞小刀的爱丽丝并不手软的收拾残局后进入了打开的树洞之中。
爱丽丝的跳跃能力果然不同凡响，应该是轻松的飞过了几个万丈悬崖。房屋中正在煮汤的巫婆将桌子上的胡椒研磨器送给了爱丽丝，看来吃素的女人可以化解一切恩怨并不是空穴来风的说法。从后门刚刚出去就遇到一群蜜蜂，要知道蜂巢才是滋生蜜蜂的关键哦。爱丽丝用胡椒炮连续攻击空中的飞猪将它赶回了女巫的餐桌，再次返回了女巫的厨房获得了些许的好处后进入小门内。爱丽丝射下空中的飞猪后色子台阶陆续出现，同时三个蜂巢也落了下来，谁说蜂巢不能用胡椒炮射击?射落第二只飞猪后色子桥铺垫完整可以通过，女石像的眼泪竟然是黑色滑腻的虫子，实在有够让爱丽丝不舒服了。
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